El clima regional y su dinámica en la Región de Coquimbo constituye un área transversal dentro de CEAZA; desde entender los procesos que conducen a fuertes nevadas en la parte alta de los valles, hasta aquellos que explican el comportamiento estacional de los vientos responsables de la surgencia costera, pasando por el impacto en la agricultura de vientos cálidos y secos (el terral de Vicuña). El conocimiento de estos procesos permite por una parte, validar los modelos de simulación del clima y, por otra, entender la variabilidad del clima del pasado reflejado, por ejemplo, en polen fósil.